水環境中存在著大量的水生生物群落，各類水生生物之間及水生生物與其賴以生存的環境之間存在著互相依存又互相制約的密切關系。當水體受到污染而使水環境條件改變時，各種不同的水生生物由于對環境的要求和適應能力不同而產生不同的反應，因此可用水生生物來了解和判斷水體污染的類型、程度。

用水生生物來監測研究水體污染狀況的方法較多，如生物群落法、生產力測定法、殘毒測定法、急性毒性試驗、細菌學檢驗等。

一、生物群落法

（1）指示生物：生物群落中生活著各種水生生物，如浮游生物、著生生物、底棲動物、魚類和細菌等。由于它們的群落結構、種類和數量的變化能反映水質狀況，故稱之為指示生物。

（2） 監測方法 

1.污水生物系統法 

 該方法將受有機物污染的河流按其污染程度和自凈過程劃分為幾個互相連續的污染帶，每一帶生存著各自的生物（指示生物），據此評價水質狀況。 

如根據河流的污染程度，通常將其分為四個污染帶，即多污帶、α-中污帶β-中污帶和寡污帶。各污染帶水體內存在著*的生物種群。

2.生物指數法

是指運用數學公式反映生物種群或群落結構的變化，以評價環境質量的數值。

貝克生物指數（BI）= 2nA + nB  BI=0時，屬嚴重污染區域，BI=1-6時，為中等有機物污染區域，BI=10-40時，為清潔水區。

二、細菌學檢驗法 

水的細菌學檢驗，特別是腸道細菌的檢驗，在衛生學上具有重要意義。實際工作中，常以檢驗細菌總數，特別是檢驗作為糞便污染的指示細菌，來間接判斷水的衛生學質量。

1、水樣的采集

:嚴格按無菌操作要求進行，防止在運輸過程中被污染，并應迅速進行檢驗。

2、 細菌總數的測定

細菌總數是指1mL水樣在營養瓊脂培養基中，于37℃經24小時培養后，所生長的細菌菌落的總數。它是判斷飲用水、水源水、地表水等污染程度的標志。

其操作過程如下：1）滅菌 ；2）制備營養瓊脂培養基 ；3）培養（二份平行樣，一份） ；4）菌落計數。

3、 總大腸菌群的測定

總大腸菌群是指那些能在35℃、48小時之內使乳糖發酵產酸、產氣、需氧及兼性厭氧的、革蘭氏陰性的無芽孢桿菌，以每升水樣中所含有的大腸菌群的數目來表示。

總大腸菌群的檢驗方法富有發酵法和濾膜法。發酵法可用于各種水樣（包括底泥），但操作繁瑣，費時間。濾膜法操作簡便、快速，但不適用于渾濁水樣。

4、其他細菌的測定